MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733620
2	NC_019678	TTG	2	6	254	259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733620
3	NC_019678	TATT	2	8	273	280	25 %	75 %	0 %	0 %	427733620
4	NC_019678	AAAG	2	8	313	320	75 %	0 %	25 %	0 %	427733620
5	NC_019678	A	6	6	383	388	100 %	0 %	0 %	0 %	427733620
6	NC_019678	GTAT	2	8	408	415	25 %	50 %	25 %	0 %	427733620
7	NC_019678	TGC	2	6	456	461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733620
8	NC_019678	GGAA	2	8	488	495	50 %	0 %	50 %	0 %	427733620
9	NC_019678	TGG	2	6	516	521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733620
10	NC_019678	AGC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733620
11	NC_019678	TAG	2	6	701	706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733620
12	NC_019678	AGG	2	6	743	748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733620
13	NC_019678	AAG	2	6	779	784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733620
14	NC_019678	AAGA	2	8	839	846	75 %	0 %	25 %	0 %	427733620
15	NC_019678	A	8	8	923	930	100 %	0 %	0 %	0 %	427733620
16	NC_019678	ATTA	2	8	1020	1027	50 %	50 %	0 %	0 %	427733620
17	NC_019678	AT	3	6	1038	1043	50 %	50 %	0 %	0 %	427733620
18	NC_019678	TAG	2	6	1142	1147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733620
19	NC_019678	CGA	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733620
20	NC_019678	TGA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733620
21	NC_019678	ACA	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733620
22	NC_019678	GAA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733620
23	NC_019678	TGG	2	6	1284	1289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733620
24	NC_019678	TAC	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733620
25	NC_019678	TA	3	6	1308	1313	50 %	50 %	0 %	0 %	427733620
26	NC_019678	A	6	6	1322	1327	100 %	0 %	0 %	0 %	427733620
27	NC_019678	TGC	2	6	1978	1983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733621
28	NC_019678	TGA	3	9	2134	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
29	NC_019678	GAA	2	6	2237	2242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733621
30	NC_019678	G	6	6	2314	2319	0 %	0 %	100 %	0 %	427733621
31	NC_019678	GTA	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
32	NC_019678	ATG	3	9	2460	2468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
33	NC_019678	CAAG	2	8	2502	2509	50 %	0 %	25 %	25 %	427733621
34	NC_019678	CAG	2	6	2547	2552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733621
35	NC_019678	AGT	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
36	NC_019678	CAG	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733621
37	NC_019678	AAC	2	6	2706	2711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733621
38	NC_019678	AGAA	2	8	2725	2732	75 %	0 %	25 %	0 %	427733621
39	NC_019678	A	7	7	2751	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	427733621
40	NC_019678	TGGAA	2	10	2833	2842	40 %	20 %	40 %	0 %	427733621
41	NC_019678	GAT	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
42	NC_019678	CAG	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733621
43	NC_019678	ACA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733621
44	NC_019678	GGA	2	6	2987	2992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733621
45	NC_019678	AAG	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733621
46	NC_019678	CAT	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
47	NC_019678	TAT	2	6	3206	3211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
48	NC_019678	CTT	2	6	3295	3300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
49	NC_019678	GATT	2	8	3393	3400	25 %	50 %	25 %	0 %	427733622
50	NC_019678	CTT	2	6	3439	3444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
51	NC_019678	CATT	2	8	3472	3479	25 %	50 %	0 %	25 %	427733622
52	NC_019678	TAA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
53	NC_019678	TGA	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
54	NC_019678	TCG	2	6	3645	3650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
55	NC_019678	ATC	2	6	3734	3739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
56	NC_019678	TCT	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
57	NC_019678	GCTC	2	8	3768	3775	0 %	25 %	25 %	50 %	427733622
58	NC_019678	ATT	2	6	3788	3793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
59	NC_019678	TCT	2	6	3837	3842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
60	NC_019678	TGA	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
61	NC_019678	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
62	NC_019678	T	6	6	3940	3945	0 %	100 %	0 %	0 %	427733622
63	NC_019678	AATT	2	8	3953	3960	50 %	50 %	0 %	0 %	427733622
64	NC_019678	TTC	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
65	NC_019678	TGCT	2	8	4037	4044	0 %	50 %	25 %	25 %	427733622
66	NC_019678	TGA	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
67	NC_019678	ATA	2	6	4135	4140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
68	NC_019678	CTC	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733622
69	NC_019678	TCA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
70	NC_019678	GAA	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733622
71	NC_019678	TTC	2	6	4355	4360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
72	NC_019678	AATT	2	8	4364	4371	50 %	50 %	0 %	0 %	427733622
73	NC_019678	GCG	2	6	4436	4441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733622
74	NC_019678	TCTAAT	2	12	4473	4484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	427733622
75	NC_019678	ACA	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733622
76	NC_019678	T	6	6	4538	4543	0 %	100 %	0 %	0 %	427733622
77	NC_019678	TTGC	2	8	4552	4559	0 %	50 %	25 %	25 %	427733622
78	NC_019678	TGTTT	2	10	4560	4569	0 %	80 %	20 %	0 %	427733622
79	NC_019678	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
80	NC_019678	GAATT	2	10	4604	4613	40 %	40 %	20 %	0 %	427733622
81	NC_019678	GTG	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733622
82	NC_019678	TAC	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
83	NC_019678	TTA	2	6	4812	4817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
84	NC_019678	TCC	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733622
85	NC_019678	TCT	2	6	4842	4847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
86	NC_019678	CAC	2	6	4930	4935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733622
87	NC_019678	TTG	2	6	4994	4999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
88	NC_019678	ACT	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
89	NC_019678	ATA	2	6	5062	5067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
90	NC_019678	GCT	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
91	NC_019678	TTG	2	6	5087	5092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
92	NC_019678	TTG	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
93	NC_019678	TGA	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
94	NC_019678	TC	3	6	5218	5223	0 %	50 %	0 %	50 %	427733622
95	NC_019678	TGA	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
96	NC_019678	TCT	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
97	NC_019678	CTG	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
98	NC_019678	ATC	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
99	NC_019678	TGC	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
100	NC_019678	TATT	2	8	5422	5429	25 %	75 %	0 %	0 %	427733622
101	NC_019678	TGA	2	6	5466	5471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
102	NC_019678	CAT	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
103	NC_019678	TTG	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
104	NC_019678	GTT	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
105	NC_019678	ACC	2	6	5669	5674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733622
106	NC_019678	AGC	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733622
107	NC_019678	T	6	6	5698	5703	0 %	100 %	0 %	0 %	427733622
108	NC_019678	GCT	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
109	NC_019678	GTA	2	6	5740	5745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
110	NC_019678	TGT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
111	NC_019678	ATG	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
112	NC_019678	GTT	2	6	5920	5925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
113	NC_019678	TGA	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
114	NC_019678	AGA	2	6	5951	5956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733622
115	NC_019678	TCT	2	6	6018	6023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
116	NC_019678	AAT	2	6	6026	6031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
117	NC_019678	TTTC	2	8	6040	6047	0 %	75 %	0 %	25 %	427733622
118	NC_019678	CA	3	6	6049	6054	50 %	0 %	0 %	50 %	427733622
119	NC_019678	TAA	2	6	6112	6117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
120	NC_019678	ATC	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
121	NC_019678	TAA	2	6	6167	6172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
122	NC_019678	AT	3	6	6181	6186	50 %	50 %	0 %	0 %	427733622
123	NC_019678	TTA	2	6	6189	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
124	NC_019678	CTA	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
125	NC_019678	GTTT	2	8	6300	6307	0 %	75 %	25 %	0 %	427733622
126	NC_019678	GAA	2	6	6315	6320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733622
127	NC_019678	T	6	6	6403	6408	0 %	100 %	0 %	0 %	427733622
128	NC_019678	ATC	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733623
129	NC_019678	TGC	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733623
130	NC_019678	AAC	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733623
131	NC_019678	TAA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733623
132	NC_019678	CA	3	6	6922	6927	50 %	0 %	0 %	50 %	427733623
133	NC_019678	TTC	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733623
134	NC_019678	CTT	2	6	6949	6954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733623
135	NC_019678	CTT	2	6	7042	7047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733623
136	NC_019678	AAT	2	6	7052	7057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733623
137	NC_019678	CTA	3	9	7066	7074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733623
138	NC_019678	TAAG	2	8	7100	7107	50 %	25 %	25 %	0 %	427733623
139	NC_019678	GA	3	6	7118	7123	50 %	0 %	50 %	0 %	427733623
140	NC_019678	TCT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733623
141	NC_019678	CT	3	6	7244	7249	0 %	50 %	0 %	50 %	427733623
142	NC_019678	CGC	2	6	7341	7346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733623
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147	NC_019678	CTG	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733623
148	NC_019678	AGC	3	9	7742	7750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733623
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151	NC_019678	ATC	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733624
152	NC_019678	ATTC	2	8	8136	8143	25 %	50 %	0 %	25 %	427733624
153	NC_019678	TTCT	2	8	8409	8416	0 %	75 %	0 %	25 %	427733625
154	NC_019678	CAT	2	6	8598	8603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733625
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156	NC_019678	ATC	2	6	8737	8742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733625
157	NC_019678	A	6	6	8755	8760	100 %	0 %	0 %	0 %	427733625
158	NC_019678	TGT	2	6	8762	8767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733625
159	NC_019678	TGCT	2	8	8779	8786	0 %	50 %	25 %	25 %	427733625
160	NC_019678	AAT	2	6	8915	8920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733625
161	NC_019678	ATT	2	6	9134	9139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733626
162	NC_019678	AAT	2	6	9205	9210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733626
163	NC_019678	CTC	2	6	9221	9226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733626
164	NC_019678	CTT	2	6	9242	9247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733626
165	NC_019678	CAT	2	6	9290	9295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733626
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167	NC_019678	TTC	2	6	9530	9535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733626
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255	NC_019678	GAA	2	6	14797	14802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733629
256	NC_019678	ACT	2	6	14900	14905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733629
257	NC_019678	T	6	6	14931	14936	0 %	100 %	0 %	0 %	427733629
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259	NC_019678	CTT	2	6	14998	15003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733629
260	NC_019678	ATT	2	6	15054	15059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733629
261	NC_019678	CAA	2	6	15088	15093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733629
262	NC_019678	GTG	2	6	15134	15139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733629
263	NC_019678	AT	3	6	15654	15659	50 %	50 %	0 %	0 %	427733630
264	NC_019678	CTG	2	6	15692	15697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733630
265	NC_019678	GTG	2	6	15704	15709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733630
266	NC_019678	CCA	3	9	15730	15738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733630
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268	NC_019678	CCA	2	6	15847	15852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733630
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271	NC_019678	GTTG	2	8	16037	16044	0 %	50 %	50 %	0 %	427733630
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297	NC_019678	TTC	2	6	17740	17745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733631
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381	NC_019678	GAC	3	9	21868	21876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733635
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387	NC_019678	CCA	2	6	23086	23091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733637
388	NC_019678	AT	3	6	23106	23111	50 %	50 %	0 %	0 %	427733637
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